通过\"直接多重成像”过滤
删除所有过滤器mSystems，2020 年 6 月 5 日在手术过程（包括过夜禁食和暴露）后，小鼠盲肠中管腔和隐窝之间微生物组的空间区划会丢失Zaborin、Alexander、Penalver Bernabe、Beatriz、Keskey、Robert、Sangwan、Naseer、Hyoju、Sanjiv、Gotel、Neil、Gilbert，Jack A.，Zaborina，Olga，Alverdy，John C.盲肠是哺乳动物肠道中的一个独特区域，其中微生物组位于两个区室：管腔和隐窝。隐窝内的微生物组特别重要，因为它与包括干细胞在内的内层上皮细胞直接接触。在这里，我们使用包括宏基因组学在内的多种技术分析了小鼠盲肠中的微生物组。管腔微生物群由 和 组成，而隐窝则以 和 为主，粘液由这 4 个门的混合物组成。管腔微生物功能潜力主要包括碳代谢，而隐窝微生物组富含编码抗逆性的基因。为了确定这种结构、组装和功能在刺激条件下如何改变，我们将小鼠置于过夜饥饿 (S)、抗生素 (A) 和重大手术损伤（部分肝切除术 [H]）中，就像重大手术中发生的那样人类中的一切。我们之前已经证明，这种\"SAH”治疗的综合作用会导致隐窝底部盲肠微生物群的严重紊乱，从而破坏隐窝细胞稳态。在这里，我们应用 SAH 条件，观察到盲肠微生物组的组成和功能的区室化丧失与局部理化线索的重大变化相关，包括缺氧减少、pH 值增加和丁酸盐产量减少。总而言之，这些研究证明了盲肠微生物组的明确顺序、结构和功能，这些微生物组在大手术及其随之而来的暴露等挑衅条件下可能会被破坏。近端结肠和盲肠是两个肠道区域，其中微生物组定位于两个空间上不同的区室，即管腔和隐窝。盲肠管腔和隐窝微生物组成和功能的差异及生理应激的影响它们的划分仍然不明确。在这里，我们表征了小鼠盲肠中管腔、粘液和隐窝相关微生物组的组成和功能。我们观察到盲肠内高度有序的微生物结构，当受到手术及其伴随的术前治疗（即过夜禁食和抗生素）等生理应激引起时，其组装和功能会明显受到破坏。局部理化线索的重大变化，包括缺氧水平降低、pH 值升高和丁酸盐产量减少，与盲肠微生物群组成和功能区划的丧失有关。
数字对象标识符 (DOI)：10.1128/mSystems.00377-20
关键词：微生物学|梅塔弗 |直接多重成像
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